Objetivo: Describir el comportamiento de la glucosa y la insulina durante las etapas del ejercicio en atletas acondicionados en ejercicio aeróbico y anaeróbico. Materiales y Métodos: En un estudio Cuasi-experimental de corte transversal se compararon la glucosa e insulina de 6 atletas anaeróbicos y 10 aeróbicos durante el reposo, ejercicio de moderada- alta intensidad y la recuperación. Se eligio un valor p de <0.05, distribución no-normal fue encontrada, y se utilizaron pruebas no paramétricas, y modelos de regresión linear. Resultados: El ejercicio moderado llevó a hipoinsulinemia, y el intenso a hiperinsulinemia e hiperglicemia. No encontramos diferencias entre los dos tipos de atletas. Conclusiones: El comportamiento del sistema nervioso autónomo afectaría el balance glucoenergético corporal durante el ejercicio aún más que la insulina, con variaciones dependiendo del tipo de entrenamiento, pero es necesario realizar estudios adicionales para evaluar esta relación.