Objetivo: Revisar el estado del conocimiento de marcadores moleculares asociados a resistencia antimalárica en la región Caribe. Materiales y métodos: Se realizó una revisión sistemática de literatura científica sobre marcadores moleculares asociados a resistencia antimalárica en la región Caribe. La búsqueda se hizo en bases de datos utilizando estos criterios: “PCR” “Plasmodium falciparum” “Plasmodium vivax” “Resistencia” “Antimalárica” “genes” en los departamentos de: Atlántico, Bolívar, Cesar, La Guajira, Magdalena, Sucre y Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina entre 2000-2020. Resultados: Se incluyeron cuatro estudios en los departamentos de Sucre (2005), Magdalena (2010) y Bolívar (2013 y 2017), se identificaron las variantes genéticas S108N en pfdhfr y A437G en pfdhps de P. falciparum en Sucre y Bolívar respectivamente, K76T en pfcrt de P.falciparum en Magdalena y F1076L - Y976F de pvmrd-1 en P.vivax de Bolívar. Los estudios del departamento de Bolívar que emplearon la secuenciación Sanger identificaron las variantes genéticas S436F- K540E en pfdhps y T958M en pvmdr-1. Conclusiones: Existen pocos estudios de marcadores moleculares asociados a resistencia antimalárica en la región, por lo que estamos lejos de definir el perfil de resistencia antimalárica en el Caribe colombiano. Es necesario hacer vigilancia molecular empleando tecnologías de vanguardia.