La mortalidad materna y perinatal representan un asunto prioritario de salud pública cuyo control reviste especial dificultad en zonas de frontera. Objetivos. Describir el comportamiento de la mortalidad materna y perinatal en los territorios fronterizos de Colombia, entre 1998 y 2016 y establecer su asociación con factores sociodemográficos, geográficos y de atención sanitaria. Métodos. Estudio observacional retrospectivo, basado en registros oficiales. Se calcularon las razones de mortalidad materna (RMM) y perinatal (RMP) para el período 1998-2016, identificando los puntos de inflexión mediante análisis de Joinpoint. Así mismo, se realizaron análisis bivariados y multivariados. Resultados. De los 54 municipios y 12 corregimientos de frontera, pertenecientes a 12 Departamentos, se obtuvieron 687 registros de mortalidad materna y 12,786 de mortalidad perinatal. Las razones observadas fueron 88 x 100,000 NV para la RMM y 16 x 1,000 NV para la RMP. La tendencia de estos tipos de mortalidad fue descendente, Los valores más altos de mortalidad perinatal se asociaron significativamente con la edad materna de 35 a 54 años, atención por régimen subsidiado, nivel educativo bajo, mujeres sin pareja, y embarazos múltiples. Conclusión. La mortalidad materna y perinatal registrada en los municipios fronterizos está por encima del promedio nacional.