El artículo tiene como objetivo valorar el funcionamiento del Sistema Interamericano de Derechos Humanos en función de su efectiva observancia, promoción y protección, ante la crisis sanitaria en la región a causa de la pandemia del nuevo Coronavirus. Se sistematizan los referentes histórico-teóricos que fundamentan el sistema, con énfasis en su proceso de fortalecimiento y repercusión en Latinoamérica, se analiza desde el punto de vista jurídico-doctrinal el funcionamiento interno del mismo, así como su gestión y eficacia en la protección de los derechos en el contexto internacional pandémico. Dentro de los resultados obtenidos se encuentra que, a pesar de sus esfuerzos por disminuir el efecto de la pandemia, mediante la Resolución No.1/2020 de su Comisión y la Declaración No.1/2020 de la Corte, hasta la fecha han sido inevitables las violaciones de derechos debido al ascenso de la pobreza y la desigualdad, ante el desplome del rendimiento económico de la región.