En este artículo se presenta el diseño de la estrategia de control para la reducción de ppm de ácido sulfhídrico, presente en el biogás crudo, extraído de unos biodigestores, mejorando así las condiciones del biogás para ser utilizado en generación eléctrica. Ante la falta de acceso a la planta, se aprovecha la disponibilidad de unos datos del funcionamiento de la torre de filtración, y utilizando redes neuronales artificiales se obtiene un modelo del proceso. Se construye con este modelo un lazo de control PID, en Simulink, para determinar los parámetros de sintonía del controlador que permitan obtener el desempeño adecuado del proceso. Para desarrollar el programa de control en un autómata programable, se utiliza la aplicación TIA Portal de Siemens, implementando la estrategia de control en un PLC serie S7-1500. Mediante intercambio de datos entre la aplicación TIA Portal y Simulink. a través de una aplicación OPC, se determina el comportamiento del proceso de acuerdo a las condiciones de diseño establecidas. Se diseña una interfaz gráfica de usuario, HMI, desde la cual el operario puede visualizar el estado del proceso o modificar algunas condiciones de su funcionamiento.