Este artículo de reflexión da cuenta del lío jurídico que se viene presentando en materia de conciliación con las entidades territoriales descentralizadas en Colombia, por la contraposición del articulado en materia de conciliación prejudicial y el amparo especial que queda expreso para los municipios en la Ley 1551 de 2012. Por ello, el objetivo principal de este texto, es analizar las controversias de la Ley 1551 de 2012 (ley de municipios), frente al Código General del Proceso (Ley 1564 de 2012) y frente al Decreto 1716 de 2009, que rigen la conciliación en materia administrativa. Su tratamiento se logra desde la investigación documental, para lo cual se hizo un traslapo de la Constitución Política con la legislación vigente y sus conexidades, así como las interpretaciones de la jurisprudencia y de otros trabajos académicos sobre el tema. La controversia toma fuerza cuando el burgomaestre y su equipo de asesores jurídicos acuden a la conciliación prejudicial en los procesos ejecutivos que se adelantan contra el municipio, amparadosen la Ley 1551. No se persigue un tratamiento exhaustivo, más bien un aporte a la comprensión del tema objeto entregando un análisis donde se visibiliza la controversia que se presentan en estas disposiciones legales.