O objetivo deste trabalho foi identificar e selecionar isolados fúngicos da Caatinga que apresentem maior potencial para a produção de quitosanase, bem como, avaliar a eficiência do método de seleção empregado, pela estimação dos coeficientes de variação genética, ambiental e da herdabilidade no sentido amplo. Os experimentos foram realizados no Laboratório de Biologia (BIOLAB) e no Laboratório de Fitossanidade do Semiárido (LAFISA), situados no Centro de Desenvolvimento Sustentável do Semiárido da Universidade Federal de Campina Grande (CDSA/UFCG). Foram utilizados neste estudo, 117 isolados fúngicos pertencente a “Coleção de Fungos da Caatinga (CFC)”. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos inteiramente casualizados com três repetições. Os tratamentos utilizados foram os 30 isolados fúngicos que se desenvolveram em meio seletivo contendo quitosana. A variável reposta utilizada foi o índice enzimático (IE). Os dados referentes ao índice enzimático foram submetidos à análise de variância, com os recursos do pacote computacional SAS. As médias dos tratamentos foram comparadas pelo teste de Scott- Knott a 5 % de probabilidade. Dentre os 117 isolados fúngicos apenas 53 isolados (45,30%) apresentaram perfil de crescimento em meio de cultivo contendo quitosana como única fonte de carbono e indutora para a produção de quitosanase. Dos 53 isolados fúngicos obtidos na pré-seleção, foram escolhidos 30 isolados para serem analisados por meio do método analítico para produção de quitosanase. A relação entre a estimativa do coeficiente de variação genética, ambiental e herdabilidade apresentaram alta relação, demonstrando a eficiência do método empregado para a seleção dos genótipos. Há grande variabilidade genética entre os 30 genótipos para a característica estudada (produção da enzima quitosanase). Os coeficientes de variação genética (CVg), herdabilidade no sentido amplo ( 2 a h ) e a razão b= CVg/CVe indicam uma situação favorável para a seleção de genótipos na característica analisada. Dezessete genótipos foram selecionados para serem submetidos a etapas posteriores do programa de melhoramento como promissores para a produção da enzima quitosanase, ou seja, apresentaram o índice enzimático maior ou igual a dois.