La parasitosis intestinal en mamíferos silvestres es una de las principales complicaciones debido a las condiciones exógenas del cautiverio. Predisponen al animal a complicaciones fisiológicas o infecciones secundarias que impiden su rehabilitación y reintroducción. El objetivo es determinar la presencia de parásitos gastrointestinales en mamíferos silvestres del Centro de Atención y Valoración de fauna silvestre del Centro de Educación Ambiental San Emigdio, San Emigdio, Palmira, Colombia. Se tomaron muestras fecales de 25 animales cautivos en el Centro de Atención y Valoración, analizándose mediante dos técnicas: a) montaje con solución salina al 0,85 % y solución de lugol al 1% y b) técnica de flotación por solución saturada (Sheather) con densidad de 1.28g/ml, encontrándose un 36% de positividad. Se encontró Enterobius vermicularis, Fasciola sp., Entamoeba sp. y Ancylostoma sp. El grupo de primates no humanos presentó cargas parasitarias más altas con respecto a felinos, caninos y demás mamíferos del estudio. Los microorganismos identificados, son reconocidos como parásitos causantes de complicaciones en animales cautivos y en vida libre; al igual, son catalogados como posibles riesgos zoonóticos.