En este trabajo se presenta una investigacion basada en el desarrollo de destrezas basicas de programacion, por medio del programa Scratch, para el mejoramiento del proceso de aprendizaje de la asignatura de Ciencias Naturales, CN. La metodologia utilizada fue cuantitativa, con un grupo control y otro experimental. La poblacion correspondio a estudiantes de grado quinto, donde se evaluaron dos grupos, cada uno de 30 estudiantes cuyas edades oscilan entre los 9 y 10 anos. Luego de utilizar Scratch con los estudiantes del grupo experimental, se encontro que mejoraron su desempeno, pasando del 54% que aprobaron la prueba diagnostica, al 85% que aprobaron la prueba final. Ademas, los estudiantes del grupo control no presentaron cambios significativos en su rendimiento. Los resultados revelan que el desempeno academico de los estudiantes en CN, puede mejorar apoyandose en actividades disenadas por ellos mismos en Scratch, facilitando la asimilacion de los conceptos de esta area.