Esta investigación presentó la propuesta de una herramienta para el diagnóstico y seguimiento de la gestión estratégica e investigativa de las instituciones dedicadas a la investigación, a partir de indicadores bibliométricos, el estándar de ISO 9001:2015, los lineamientos para la medición y reconocimiento de investigadores y grupos de investigación de Colciencias, con el fin de establecer los indicadores mínimos y los elementos de gestión de procesos que faciliten la toma de decisiones a partir del análisis de resultados. La investigación se desarrolló en dos fases; la primera consistió en una revisión documental para determinar los aspectos de evaluación de la calidad de las investigaciones, indicadores bibliométricos más relevantes, los lineamientos de Colciencias y las escalas de madurez de gestión de proyectos; por su parte, en la segunda fase se realizó el diseño de la herramienta diagnóstica.