El objetivo del presente estudio fue evaluar la calidad del agua en la cuenca media del Rio Guatapurí (Colombia), a través de análisis de macroinvertebrados acuáticos. Se determinaron los índices de calidad del agua BMWP/Col y ASPT y se estimaron los índices de diversidad alfa. Los 1640 organismos colectados están agrupados en 5 clases, 12 órdenes y 34 familias. La composición de taxones fue diversa y la clase Insecta fue dominante. El orden Hemiptera fue el más diverso y abundante y no se presentaron diferencias en la riqueza ni en la abundancia a nivel espacial. La diversidad alfa presento diferencias significativas entre los diferentes índices ecológicos. Los índices BMWP/Col y ASPT reflejaron una condición de calidad buena, indicando aguas limpias. Se concluye que la cuenca media del Rio Guatapurí se encuentra una buena condición ecológica, después de la valoración y comparación de índices univariados y multivariados.