La colección de mamíferos del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt es la tercera colección de mayor número de especímenes en el país con 9.471 determinados en 400 especies, 212 géneros, 51 familias y 14 órdenes, procedentes de ocho países, siendo Colombia el de mayor representatividad (66,5% de la diversidad registrada para el país en este grupo). Los órdenes mejor representados son Chiroptera, Rodentia y Primates. Alberga un neotipo y dos paratipos de Cebus albifrons albifrons, un paratipo de Aotus hershkovitzi y un paratipo de Vampyressa sinchi. La colección ha sido un referente para el estudio de mamíferos colombianos y se continúan realizando esfuerzos para mejorar el estado curatorial y la información asociada a los especímenes.