Este articulo presenta los resultados de un estudio sobre la calidad microbiana del aire realizado en el area de urgencias del Hospital Universitario Mayor- Mederi en Bogota, durante el periodo comprendido entre octubre y diciembre de 2016. El objetivo principal fue determinar el riesgo de transmision de infecciones por la presencia de microorganismos en bioaerosoles, como agentes que pueden causar infeccion, alergia o inducir un efecto toxico en el cuerpo humano; especialmente en pacientes inmunodeficientes. Fueron tenidos en cuenta, los limites permisibles fijados para bacterias y hongos por la Organizacion Mundial de la Salud (OMS), estableciendo el riesgo por microorganismos a partir de sus concentraciones en los diferentes puntos de muestreo, su implicacion clinica y la frecuencia de aparicion, ademas de las variables ambientales de temperatura, humedad relativa y velocidad del viento. Asi mismo, se senalo la relacion entre las variables, el flujo; y cantidad de personas. Las muestras de bacterias y hongos en el aire se recolectaron mediante el metodo de impactacion de Andersen, utilizando el equipo MAS 100- ECO . Como resultado se obtuvo un total de 42 morfotipos: 29 bacterias y 13 hongos; evidenciando que estos ultimos sobrepasan los limites permisibles, siendo los pasillos que conectan a la salida de las ambulancias y salas de cuidado intermedio; las zonas de mayor riesgo de infeccion por Cladosporium spp, es decir, lugares donde hay un alto flujo de personas.