El objetivo de este artículo es analizar el estado de la discusión e implementación en Colombia de dos herramientas de racionalización para la Jurisdicción Especial para la Paz (en adelante JEP): la priorización y la selección de casos. El artículo analiza los desarrollos políticos y normativos a la fecha y concluye que ambos instrumentos, especialmente el de selección, fueron incluidos genérica y vagamente en el Acuerdo de Paz y que su desarrollo normativo ha sido paulatino y accidentado. En consecuencia, la JEP no cuenta con un marco concreto para desarrollar estas herramientas. Por ello, en la sección final, el artículo presenta una propuesta escalonada de aplicación de las herramientas que tiene un doble fin. Por un lado, operacionalizar las herramientas; por el otro, asegurar que estas respetan los estándares constitucionales e internacionales de investigación, juzgamiento y sanción de graves violaciones a derechos humanos.