El presente estudio tuvo por objetivo comparar las lesiones histológicas de truchas arcoíris (Oncorhynchus mikyss) afectadas por la Enfermedad Bacteriana del Agua Fría (BCDW) con muestras de piel de truchas asintomáticas procedentes de centros piscícolas en el Lago Titicaca (Puno, Perú) e identificar la presencia de Flavobacterium psychrophilum mediante PCR convencional. Se trabajó con 13 truchas con lesiones de piel y siete sin lesiones, con tallas superiores a los 25 cm y peso promedio de 350 g. En el PCR para la identificación de F. psychrophilum se utilizaron iniciadores dirigidos a la región 16S ARNr. Molecularmente, ambos grupos de animales resultaron positivos para la presencia de F. psycrophilum. Se puede concluir que este patógeno está presente en la zona sur del país.