El punto de partida del Doctor Padrón gira alrededor de la pregunta qué es la investigación científica, partiendo del hecho que no se puede enseñar algo que no se conoce, pues cómo pueden formarse investigadores si se desconocen qué son los procesos de investigación, así que se requiere una teoría para tales procesos, que permita entender la manera en que se generan los nuevos conocimientos. Esta teoría, en el pensamiento del Doctor Padrón, gira alrededor de conceptos como qué es lo cognitivo, la investigación, la ciencia, y qué es teoría, creando una teoría cognitiva de la investigación científica. 
 En este propósito se requiere definir algunos conceptos y relacionarlos para responder a la pregunta ¿Cómo se relaciona la teoría con la cognición, con la investigación y con la ciencia? Para abordar esto él define una familia de conceptos, como la metodología, la filosofía de la ciencia y la epistemología. Plantea el Doctor Padrón que la metodología, que ha sido regularmente tomada como un punto de partida de la investigación, es más un obstáculo para ésta, y señala que no la considera una referencia para la construcción de una teoría de la investigación