Esta investigación aborda la propuesta estatal para la garantía del derecho a la salud para las víctimas del conflicto armado colombiano, haciendo énfasis en el enfoque diferencial planteado en dichas indicaciones. Esta indagación se realizó a través del análisis crítico: documental, en el trabajo de campo y de la aproximación gubernamental al concepto del enfoque diferencial desarrollado en el protocolo de atención en salud, por parte del Estado, para las víctimas. Se identifican las debilidades y retos para la implementación de dicho protocolo, en el uso del concepto de enfoque diferencial y la apropiación de la interseccionalidad como un concepto emergente.