O presente estudo procura identificar fatores que influenciam os custos nos centros de saúde administrados pela Secretaria Municipal de Saúde de Florianópolis, SC, Brasil, segundo a Gestão Estratégica de Custos –GEC–. Uma revisão da literatura da GEC para o contexto pesquisado permitiu identificar as variáveis representativas de cada cost driver. Foi realizada uma pesquisa de levantamento nos 49 centros de saúde da SMS para relacionar as variáveis com o custo. Constatou-se, a partir das variáveis do cost driver “escala”, que os centros de saúde que possuem maior demanda de pacientes necessitam de estruturas maiores, tendo um impacto mais rápido nos custos. Já outros cost drivers como “experiência” ou “Eficiência das Instalações” mostram uma incidência menor nos custos.