El deterioro de los tomates por el efecto de los hongos ha sido reconocida como una fuente de posible peligro para la salud de humanos y animales. La panta Datura stramonium posee alta actividad biológica antifúngica, debida a la presencia de alcaloides tropánicos. En este trabajo se evaluó la actividad de los extractos provenientes de la flor y la semilla de la planta Datura stramonium, midiendo el diámetro del halo de crecimiento de un hongo nativo del tomate en un medio sólido PDA enriquecido con 10 microlitros de extracto. Los porcentajes de inhibición fueron del 90 % para el extracto de la flor y del 100% desde el día 2 del ensayo para el extracto de la semilla. Con el fin de identificar la naturaleza química de los metabólitos que presentaron actividad antifúngica, se realizaron análisis mediante cromatografía líquida HPLC/UV, y espectrofotometría IR. Este estudio permitió confirmar que los metabolitos extraídos fueron alcaloides tropánicos, pero sustancias diferentes si su fuente era la semilla o la flor.