El Centro de Emprendimiento e Innovación de la Universidad Surcolombiana, unidad adscrita a la Rectoría y creado por Acuerdo 004 de 2015 por el Consejo Superior, tiene la misión de “Promover y gestionar la cultura del emprendimiento y la innovación en la comunidad universitaria, a partir de la identificación y estructuración de ideas y proyectos de creación y fortalecimiento de iniciativas emprendedoras de carácter social, cultural, deportivas y empresariales, que conjuguen con un enfoque sistémico la investigación, el conocimiento, la interdisciplinariedad, la innovación y el emprendimiento de alto impacto para el crecimiento económico y social de la región y el país”.