El ajonjoli es un cultivo importante en regiones tropicales, el cual es afectado por hongos del suelo como Macrophomina phaseolina y Fusarium sp. Con el objetivo de identificar y caracterizar a Fusarium spp. como causante de pudricion en plantas de ajonjoli en campo, se obtuvieron diez aislados. Once caracteristicas distintivas a nivel taxonomico se determinaron sobre los diez aislados, y adicionalmente se midio la velocidad de crecimiento en capsulas de Petri. A nivel molecular, la caracterizacion de los diez aislados, se desarrollo utilizando la tecnica molecular de ADN polimorfico amplificado al azar (RAPD) mediante el uso de cinco cebadores o “primers”. Se identificaron tres especies de Fusarium oxysporum (2 aislados), Fusarium solani (7 aislados) y Fusarium semitectum (1 aislado). Investigaciones anteriores al presente trabajo indican que el ajonjoli es solo afectado por F. oxysporum f. sp . sesami , solo un reporte previo indica que tambien F. solani causa la pudricion de Fusarium en este cultivo. La velocidad de crecimiento in vitro se ubico en un rango entre 0,21-0,29 mm h -1 , sin ningun patron identificable de acuerdo a la especie. El crecimiento de uno de los aislados de F. oxysporum fue estadisticamente (P<0.05) mas rapido que los otros aislados evaluados. Cincuenta bandas RAPD (92% polimorficas) no pudieron diferenciar las tres especies identificadas de Fusarium . El coeficiente de similitud de Jaccard estuvo entre 0,15 y 0,47 con un promedio de 0,32. PALABRAS CLAVE : Pudricion por Fusarium, F. solani , F. oxysporum , F. semitectum, RAPD. RESUMO O gergelim, uma cultura importante em regioes tropicais e seriamente afetada pelos fungos do solo Macrophomina phaseolina e Fusarium sp. A fim de identificar e caracterizar Fusarium spp. causadores da podridao em plantas de gergelim no campo, dez isolados foram obtidos. Varios carateres taxonomicos distintos foram determinados nos dez isolados, e a taxa de crescimento em placas de Petri foi medida adicionalmente. Para mais detalhes da caracterizacao dos dez isolados, utilizou-se a tecnica molecular de DNA polimorfico amplificado ao acaso (RAPD), atraves de cinco iniciadores ou primers. Foram identificadas sob criterio morfologico tres especies; Fusarium oxysporum (2 isolados), Fusarium solani (7 isolados) e Fusarium semitectum (um isolado). Relatorios anteriores indicam que o gergelim e afetado apenas por F. oxysporum f. sp. sesami , no entanto, um relatorio anterior indica que F. solani, tambem pode causar a podridao de fusarium nesta cultura. A taxa de crescimento in vitro foi na faixa entre 0,21- 0,29 mm. h-1, sem qualquer padrao identificavel de acordo com a especie. O crescimento de um dos isolados de F. oxysporum foi estatisticamente (P <0,05) mais rapido que os outros isolados avaliados. Cinquenta bandas de RAPD (92% polimorficas) nao conseguiram diferenciar as tres especies de Fusarium identificadas morfologicamente. O coeficiente de similaridade de Jaccard foi entre 0,15 e 0,47 com uma media de 0,32.