Este estudio determino la diversidad y estructura genetica presente en grupos poblacionales de gatos domesticos (Felis catus), utilizando marcadores de pelaje en Tolu-Sucre y muestreos aleatorios entre los meses de septiembre y diciembre del ano 2016, se caracterizaron fenotipicamente 242 animales adultos en cinco barrios de Tolu, atendiendo a los marcadores autosomicos de codificacion morfologica: el locus ligado al sexo Orange (O) y los loci autosomicos Non-agouti(a), Blotched tabby (Tb), Dilution (d), Pelo largo (l) Manchado de blanco (S) y Dominante blanco (W). Los parametros geneticos poblacionales: frecuencia alelica, diversidad genetica, flujo genico, equilibrio Hardy-Weinberg y distancia genetica fueron calculados mediante el programa PopGene; la estructura genetica mediante el programa FSTAT. El marcador Manchado de blanco mostro la mayor frecuencia mientras los genes Non-agouti y Pelo largo exhibieron los valores mas bajos. Se obtuvieron valores poco significativos de variabilidad genetica a nivel global y poblacional. Asi mismo, se obtuvo una escasa diferenciacion genetica entre poblaciones y un elevado flujo genico; se observo exceso de heterocigotos a nivel poblacional y a nivel total y ausencia de equilibrio Hardy-Weinberg respecto a los marcadores Orange y Manchado de blanco.