El interés global por conocer y controlar las enfermedades que afectan a humanos y animales ha permitido modelar enfermedades mediante diversos métodos (modelos matemáticos, estocásticos, discretos) que se aplican actualmente para predecir la propagación de nuevas epidemias, reducir el contagio de enfermedades infecciosas, evaluar el impacto que tendrán las diferentes estrategias de control de enfermedades y mejorar las condiciones de vida de los individuos. Actualmente, nuevas técnicas y herramientas se están implementando para modelar enfermedades infecciosas, el presente documento describe conceptos de esta área, así como las tendencias y retos existentes, finalmente se ofrecen al lector algunos criterios a considerar para la selección de un modelo epidemiológico.