Las raíces sumergidas de Rhizophora mangle son un importante soporte para parte de la comunidad de organismos que forman un subsistema con organización y estructura dinámica propia. Son útiles como criadero de peces, camarones, cangrejos y mejillones, entre otros. El objetivo de esta investigación fue determinar la composición y la abundancia de la taxocenosis de moluscos y crustáceos asociados a las raíces sumergidas de R. mangle y su relación con algunas variables fisicoquímicas del agua en el estuario del río Ranchería. Los muestreos se llevaron a cabo entre los meses de septiembre del 2014 y marzo del 2015, en cinco estaciones de muestreo. Tres estaciones asociadas al brazo El Riíto y dos en el brazo Calancalá. En cada muestreo y en cada sitio se midieron algunas variables fisicoquímicas (salinidad, temperatura, oxígeno disuelto, pH, alcalinidad, dureza y turbidez). En cada estación se cortaron al azar dos raíces de mangle sumergidas, las cuales se colocaron en bolsas plásticas con formalina al 10 %. En el laboratorio se cuantificaron e identificaron las muestras. Se encontró un total de 38 taxones, correspondiente a un 57,89 % de moluscos y 42,11 % de crustáceos para toda el área de estudio. Aunque las estaciones estudiadas presentaron diferencias significativas entre ellas, en cuanto a salinidad y pH, la taxocenosis de moluscos y crustáceos se considera muy uniforme con una similitud mínima de 68 % entre las estaciones. Se concluye que el bivalvo Mytiliopsis leucophaeata y el anfípodo Americorophium brevis fueron las especies más abundantes, por ser especies estuarinas típicas de sustratos duros, dominando la taxocenosis en el delta del río Ranchería, el cual presenta una baja riqueza de especies de moluscos y crustáceos, que se debe principalmente al amplio cambio de salinidad a lo largo del periodo estudiado.