El presente articulo hace parte del trabajo de investigacion «Estrategias de produccion, extraccion y proteccion en los territorios de las comunidades Embera de Jarapeto, Jengado y Narangue del Medio Atrato Antioqueno», que se realizo en coordinacion y a solicitud de la Organizacion Indigena de Antioquia y del Instituto de Investigaciones Ambientales del Pacifico. Para ello se trabajo en el territorio de tres comunidades indigenas asentadas en la region del Atrato Medio Antioqueno, en sistemas agroforestales tanto tradicionales como introducidos. Metodologicamente se tomo como unidad basica de muestreo 10 sub-parcelas rectangulares de 50 m2 cada una (500 m2 en total). Se pudo determinar e identificar la composicion floristica representada en 20 familias, 26 generos y 30 especies. Tambien se reconocieron y evaluaron parametros de estructura horizontal calculados a partir de la frecuencia, dominancias y abundancias absolutas y relativas. Asimismo se obtuvieron valores de diversidad mediante los indices de Shannon, cociente de mezcla y de estructura vertical que permite hacer comparaciones con otros trabajos en agroforesteria de tierras bajas tropicales con diferentes comunidades rurales. Asi se pudo concluir que parte del sistema agroalimentario embera se fundamenta en principios y practicas agroforestales de alto valor ambiental y de fuerte arraigo cultural.