En este trabajo se evalúa la eficiencia en la extracción del glucósido cianogénico amigdalina de semillas de manzanas (Malus pumila Mill) empleando las técnicas tradicionales con solventes de reflujo y Soxleth, las cuales son comparadas con la técnica más contemporánea de microondas. Las eficiencias de extracción son determinadas a través de cromatografía líquida de alta eficiencia (HPLC) empleando un método estandarizado que requiere tiempos de retención de alrededor de 1 minuto. La mejor separación cromatográfica es obtenida con el método de reflujo; sin embargo, la eficiencia de separación total más alta es alcanzada empleando la técnica de microondas, la cual requiere de solo un 10% del tiempo total y solventes necesarios en las extracciones por reflujo y Soxhlet. En contraste, la mayor cantidad de extraída de amigdalina de las semillas es obtenida con la técnica de Soxhlet, la cual corresponde al triple y al doble de las cantidades que logran ser extraídas con las metodologías de reflujo y microondas respectivamente. La pureza e identificación estructural de la amigdalina extraída es verificada espectroscópicamente usando las técnicas de UV-vis, RMN (1H and 13C) y FTIR.