Este artículo establece una perspectiva especial del debido proceso en el contexto de la jurisdicción especial para la paz como garantía de doble naturaleza, como derecho humano en el ámbito internacional y como derecho fundamental en el nacional. El objetivo es analizar y evaluar el alcance de la carga de la prueba en el proceso jurisdiccional en la justicia transicional colombiana, en razón del carácter excepcional de esta, imbricado dentro de la perspectiva de la teoría constitucional actual. Como conclusión, el contenido de la carga de la prueba puede ser relativizado bajo el ejercicio de ponderación, cuando este resulte en ganancias mayores en términos de principios constitucionales como la obtención de la paz y la construcción de la verdad en un contexto de conflicto.