Introducción: La malnutrición abarca la desnutrición, el sobrepeso y la obesidad, generada por desbalance alimentario y presencia de determinantes sociales de la salud (DSS) que afecta principalmente a la población infantil. Objetivo: Identificar la prevalencia de malnutrición y su asociación con DSS, en menores de 5 años pertenecientes al Sistema de Selección de Beneficiarios para Programas Sociales (SISBEN) del área urbana del municipio de Palermo. Materiales y métodos: Estudio de corte transversal, con enfoque analítico. Muestra de 254 niños menores de 5 años pertenecientes al SISBEN, residentes del área urbana del municipio de Palermo. La información socioeconómica se recolectó por una encuesta y la clasificación nutricional por valoración antropométrica. Resultados: El 6,7% presentaron malnutrición por déficit y 9,8% por exceso. Se encontró asociación entre desnutrición crónica con hacinamiento (p=0,03; RP=1,9 IC: 95% 1,138 - 3,173) y con bajo ingreso económico, (p=0,004; RP=1,96 IC: 95% 1,22 - 3,15); entre desnutrición aguda y disposición inadecuada de basuras (p=0,03; RP=6 IC: 95% 4,2 - 8,7); y entre desnutrición global con bajo ingreso económico (p=0,02; RP=2,2 IC: 95% 1,11 - 4,35) y vivienda inadecuada (p=0,03; RP=2,08 IC: 95% 1,06 - 4,06). Conclusiones: Coexisten los dos extremos de malnutrición: por exceso y por defecto, ésta última, relacionada con determinantes: hacinamiento, bajo ingreso económico familiar y disposición inadecuada de basuras.