Introducción. El trasplante de intestino mejora la supervivencia de pacientes con falla intestinal secundaria al síndrome de intestino corto. Estos receptores tienen gran riesgo de rechazo agudo, por lo cual, de manera pro- tocolaria y como método de referencia, se practican biopsias intestinales.En este reporte de caso se hizo el seguimiento inmunológico de anticuerpos anti-HLA por tecnología LuminexTM (LSA) de un paciente con trasplante de intestino más biopsias por protocolo para un diagnóstico temprano, y una adecuada correlación histológica.