El objetivo del presente estudio piloto fue analizar la toxicidad de los sedimentos del río Pasto en el tramo La Playita-Puente La Carolina en la cuenca alta, una zona con importante actividad agropecuaria donde el agua tiene múltiples usos, utilizando bacterias bioluminiscentes Vibrio fischeri como bioindicadores de toxicidad. El estudio se basó en la hipótesis de que ciertos microcontaminantes derivados del uso pesticidas en la zona, son transportados entre las matrices aguas/sedimentos y son los responsables de los niveles de toxicidad hallados. Los resultados señalan niveles variables de toxicidad y posiblemente el fenómeno predominante sea el transporte de pesticidas o sus metabolitos en la masa de agua. Además, se infiere que posiblemente la concentración de plaguicidas no sea la principal causa de los niveles de toxicidad hallados y probablemente podrían asociarse a otras sustancias derivadas del vertimiento de aguas residuales y lixiviados.