Se plantea una aproximación de medición de la eficiencia de la producción científica mediante el Data Envelopment Analysis (DEA): modelos CCR y Assurance Region (AR) con base en los indicadores de ciencia, tecnología e innovación (CTI) en los departamentos y en el Distrito Capital (D.C.) de Colombia. Se concluyó que ambos modelos calculan la eficiencia de las unidades de análisis, siendo AR susceptible a jerarquizaciones generadas en las variables de acuerdo a los objetivos país en temas de CTI.