Este artículo presenta el desarrollo de una nueva metodología para la estimación de permeabilidades relativas, por medio del ajuste de la simulación con los resultados experimentales, obtenidos de desplazamientos en estado no-estacionario.Se muestra también el desarrollo en lenguaje Matlab, de la herramienta de simulación/optimización, que permite el ajuste automático.Seis desplazamientos de estado no-estacionario son realizados, cuatro de dos fases y dos de tres fases, la información experimental obtenida se analiza por medio del algoritmo propuesto.Los resultados obtenidos para dos fases se comparan con los del software Sendra y se encuentra que el algoritmo propuesto tiene un buen desempeño respecto a esta herramienta comercial.Los resultados obtenidos para los casos de tres fases