Objetivo: Evaluar la eficacia in vitro de la pasta de Ca(OH)2 en agua destilada y gel de digluconato de clorhexidina (CHX) al 0.2%, separadamente, como medicaciones intraconducto frente a Candida albicans en raíces de dientes humanos extraídos.Materiales y métodos: Mediante un estudio experimental in vitro, en el que se utilizaron 45 raíces uniradiculares, previamente inocula-das con Candida albicans, ATCC6455017 durante 72 horas y que luego fueron medicadas intraconducto con pasta de Ca(OH)2 (Eufar®) en agua destilada p/v 50% y con gel de digluconato de clorhexidina al 0.2% (Perioxidin®), durante 7 días; en el siguiente paso, cada espécimen radicular fue instrumentado con limas Hedstrom de la segunda serie para obtener barrillo dentinario del sistema del canales radiculares, el cual se diluye en 5 ml de tripticasa soya que se siembra en agar saboraud al 2%, durante 72 horas a 37°C, para determinar (UFC/ml) de esta levadura.Resultado: La eficacia de la pasta de Ca(OH)2 fue del 62.5% y la del gel de CHX al 0.2% fue de 6.25%. El ANOVA reveló diferencias esta-dísticamente significativas (p=0.0013) entre los promedios de UFC/ml de Candida albicans, entre las medicaciones. También, el test de Bonferroni estableció diferencias significativas entre los promedios de UFC/ml de Candida albicans después de medicar con pasta de Ca(OH)2comparado con gel de CHX al 0.2% (p=0.002) y el grupo control (p=0.010). Sin embargo, no se encontraron diferencias significativas entre el tratamiento con gel de CHX al 0.2% y el grupo control.Conclusiones: Se demostró, in vitro, que Candida albicans es capaz de establecerse al interior del sistema del canal radicular e interactuar con la dentina.[Bedoya LF, Niño MP, Peña CM, Toloza E. Evaluación in vitro de la eficacia antifúngica del hidróxido de calcio en agua destilada y del gel de digluconato de clorhexidina al 0.2% como medicación intraconducto frente a Candida albicans. Ustasalud 2008; 7: 77 - 86]