Logotipo ImpactU
Autor

Basic k-mer operations using massive parallel processing on heterogeneus architectures

Acceso Cerrado

Abstract:

In this article is presented and assessed a massive parallel processing model for basic operations with k-mers from genomic sequences, based on defined functions in terms of N-dimensional spaces. The model is implemented using a set of OpenCL cores available at github.com/bioinfud/k-merscl and assessed using a heterogeneous platform CPU/GPU and a dataset based on randomly generated kmers. The results make evident a maximum speed up factor of 4898X and a minimum of 350X.

Tópico:

Gene expression and cancer classification

Citaciones:

Citations: 0
0

Citaciones por año:

No hay datos de citaciones disponibles

Altmétricas:

Paperbuzz Score: 0
0

Información de la Fuente:

FuenteNo disponible
Cuartil año de publicaciónNo disponible
VolumenNo disponible
IssueNo disponible
Páginas193 - 196
pISSNNo disponible
ISSNNo disponible
Perfil OpenAlexNo disponible

Enlaces e Identificadores:

Artículo de revista