<p class="p1">El objetivo de este trabajo fue evaluar la estructura genética en poblaciones de gato doméstico (<em>Felis catus</em>) mediante marcadores que codifican la coloración y el diseño y longitud del pelaje en Sahagún, Córdoba, Colombia. Mediante observaciones directas en recorridos por las zonas urbanas pertenecientes a seis barrios de Sahagún, entre mayo y agosto de 2015, se muestrearon aleatoriamente 153 gatos adultos, utilizando la nomenclatura recomendada por el Committee on Standardized Genetic Nomenclature for Cats (1968), atendiendo a los marcadores fenotípicos: <em>O: Orange</em>;<em> a: Non-agouti</em>;<em> Tb: Tabby blotched</em>;<em> d: No diluido</em>;<em> l: Pelo largo</em>;<em> s: Manchado de blanco</em>; <em>W: Dominante blanco</em>. Se midieron: frecuencia alélica, flujo génico y equilibrio Hardy-Weinberg a través del programa PopGene 1.31; la estructura genética mediante el programa FSTAT v. 2.9.3.2. El marcador <em>Manchado de blanco</em> fue el de mayor frecuencia, el <em>Dominante blanco</em> presentó los valores más bajos de las frecuencias alélicas, se obtuvo escasa diferenciación genética entre las poblaciones y un elevado flujo génico; se observó un exceso de heterocigotos a nivel poblacional y a nivel total, no hubo equilibrio Hardy-Weinberg en todas las poblaciones con relación a los marcadores <em>Orange</em> y <em>Manchado de blanco</em>; y se evidenció selección natural y artificial para estos marcadores.</p>