Introduccion: Actualmente, se conocen aproximadamente 250 millones de casos de ITU por ano en todo el mundo siendo Eschericha coli el agente causal mas frecuente (75%-95%), la virulencia de este microorganismo se encuentra en constate analisis, la cual esta asociada a su vez con factores de resistencia lo que convierte a esta bacteria en un patogeno de importancia por su emergencia como microorganismo multiresistente. Objetivo: Identificar los genes patogenicos stx1, stx2, STp, eae, ast A, cdt, cnf y STp, presentes en E. coli uropatogena. Materiales y metodos: Estudio descriptivo de corte transversal. Durante los meses de mayo y agosto del 2014 se recolectaron 275 muestras de cepas sospechosas de ser E. coli , aisladas de orina, en la seccion de microbiologia del laboratorio clinico de especialidades Bolivar S. A., fueron entregadas en agar chromo ID TM con colonias rojas caracteristicas de E. coli . De cada cepa se realizo siembra en bateria bioquimica para la identificacion fenotipica del microorganismo y antibiograma por metodo con Kirby-Bauer, usando 18 antibioticos pertenecientes, por identificacion molecular se realizo clasificacion de los grupos filogeneticos segun Clermont, O, Bonacorsi, S. and Bingen, E (2000), obteniendo un 45.6% de cepas clasificadas de baja virulencia. Se realizara la determinacion de la presencia de genes que permiten la identificacion de los patotipos de E. coli , por medio de una PCR multiple para detectar los genes stx1, stx2, STp, eae, ast A, cdt, cnf y STp. La extraccion de ADN bacteriano se realizara por choque termico, la pureza y cantidad de ADN se cuantificara en NanoDrop 2000C. Posteriormente, se realizara la amplificacion de los genes en tres PCR multiples. Resultados: De acuerdo al grupo filogenetico, se es necesario revisar los diferentes mecanismos moleculares de patogenicidad propia de la cepa, ademas de observar la similitud en la presencia de los genes segun el grupo, considerando las cepas como patogenas y no virulentas.