Las enfermedades infecciosas del tracto respiratorio inferior son la principal causa de muerte de ninos menores de 5 anos en los paises en via de desarrollo. En la edad pediatrica existen diferentes agentes etiologicos que podrian comprometer la via area. El conocimiento de estos agentes con sus principales manifestaciones clinicas es de vital importancia para que el personal medico pueda realizar un adecuado diagnostico y finalmente un tratamiento especifico. En el presente articulo, a partir de una busqueda sistematica de la informacion sobre las neumonias, especialmente aquellas causadas por germenes atipicos y sumando recomendaciones dadas por los autores con base en algoritmos diagnosticos se muestran una serie de pasos que se proponen como una herramienta de acercamiento clinico y diagnostico de estas entidades.