Objetivo. Caracterizar genéticamente las poblaciones de paloma doméstica (Columba livia) en Bogotá, Colombia, utilizando genes que codifican la coloración y diseño del plumaje. Materiales y métodos. Se realizaron muestreos aleatorios en 28 colonias en la ciudad de Bogotá en el periodo comprendidos entre enero y junio del año 2014. Mediante excursiones urbanas, observación directa y registros fotográficos se estudiaron 2903 palomas. Se utilizaron los marcadores autosómicos que codifican la coloración y diseño del plumaje: Grizzle (G); Spread (S); Checker (C), y el locus ligado al sexo Ash-Red (B). Los parámetros genéticos: frecuencia alélica, diversidad genética, equilibrio Hardy-Weinberg y estructura poblacional fueron calculados a través del programa PopGene 1.31; la estructura genética y la distancia genética se evaluaron mediante el programa FSTAT v. 2.9.3.2. La elaboración del dendrograma se realizó empleando el programa MEGA 5. Resultados. Los marcadores que presentaron las mayores frecuencias alélicas fueron Checker y Spread. Se registraron valores poco significativos de variabilidad genética y una escasa diferenciación genética entre las poblaciones, acompañado de un elevado flujo génico; se observó un exceso de heterocigotos; a esto se le suma la ausencia de equilibrio Hardy-Weinberg y se reportaron valores bajos de distancia genética. Conclusiones. Las poblaciones se encuentran muy relacionadas genéticamente, situación que puede obedecer a la cercanía geográfica existente entre ellas, lo que ha favorecido el intercambio genético