Solo dos especies de Neisseria son consideradas patogenas para el hombre: N. gonorrhoeae y N. meningitidis. El diagnostico microbiologico se realiza en dos etapas: presuntiva y confirmatoria. La identificacion presuntiva se hace con la tincion de Gram y la prueba de la oxidasa y la confirmatoria se basa en pruebas bioquimicas y serologia, realizandose generalmente en laboratorios de referencia. Se describen dos casos clinicos de infeccion por Neisseria sp donde el diagnostico microbiologico confirmatorio difirio de la presuncion clinica inicial. Un caso correspondio a una endocarditis infecciosa por N. gonorrhoeae en un paciente de 54 anos previamente sano, y el otro a un recien nacido de 26 dias con conjuntivitis por N. meningitidis. Se revisa la literatura sobre estas manifestaciones inusuales y se discute la importancia de disponer de pruebas confirmatorias rapidas para un adecuado manejo medico y epidemiologico