Objetivo: analizar la capacidad institucional y la participación comunitaria del sector salud de los municipios de los departamentos de Antioquia, Caldas y Risaralda, según su categoría socioeconómica. Métodos: se realizó una encuesta por correo a todos los municipios (164) de los departamentos de Antioquia, Caldas y Risaralda, de los cuales respondió el 56%. Se realizó un análisis descriptivo de los datos, análisis de componente principal y finalmente, análisis de correlaciones. Resultados: se encontró que el nivel de desarrollo institucional del sector salud de los municipios no está acorde con su categoría socio-económica; tampoco los municipios tienen un desarrollo integral de los diferentes aspectos de su capacidad institucional. Algunos municipios pequeños y con bajo nivel socioeconómico presentan desarrollos similares y aún mejores que municipios de mayor nivel socioeconómico.