Introduccion: Se determino la seroprevalencia de los virus linfotropicos humanos tipos I y II (HTLV-I y II) en varios municipios del Departamento de Cordoba. Materiales y metodos: Se analizaron 962 muestras de suero mediante la prueba de ELISA y de Western blot confirmatorio. Se analizaron geneticamente 5 aislamientos virales por RFLP y secuenciacion de la region LTR. Resultados: Se confirmaron 20 aislamientos como HTLV-I y uno como HTLV-II. La seroprevalencia de la infeccion por el HTLV-I en la muestra obtenida del departamento de Cordoba fue 2.1% (20/962), y para el HTLV-II 0.1% (1/962). Mediante analisis geneticos se determino que tres correspondieron al subtipo africano b y dos el cosmopolita a. Conclusion: Este es el primer registro de la infeccion tanto por HTLV-I como por HTLV-II informado para el departamento de Cordoba en Colombia.