Los capibaras son los roedores más grandes delmundo, sin embargo, no se han realizado estudios gené-tico poblacionales exhaustivos con ellos. En el presentetrabajo se analizó la estructura genética de una manadade 31 capibaras (Hydrochoerus hydrochaeris) muestreadaen Hato Corozal, Departamento de Casanare en los Llanos Orientales de Colombia, mediante cinco marcadoresmicrosatelitales. La diversidad genética se determinó en0.61 y un número promedio de alelos de 5.2, lo cual sepuede considerar medio-bajo para este tipo de marcadores. De los cinco marcadores empleados, tres mostraronproporciones genotípicas en concordancia con lo esperadoen equilibrio Hardy-Weinberg, mientras que un marcadormostró un exceso significativo de homocigotos y otro unexceso significativo de heterocigotos. No se encontrarondiferencias significativas para esos cinco marcadores entremachos y hembras de la manada muestreada. La aplicaciónde diferentes procedimientos para detectar posibles cambios demográficos históricos (expansiones poblacionaleso cuellos de botella) mostró claramente que la poblaciónanalizada ha pasado por un cuello de botella extremadamente fuerte en épocas recientes. La limitada variabilidad genética encontrada y la fuerte evidencia de que la manada estudiada ha pasado por un cuello de botella reciente es probablemente el resultado de la cacería ilegal.