La contaminacion del agua ha incidido para que se convierta en el principal medio de transporte de microorganismos patogenos, razon por la cual se han generado sistemas de tratamiento naturales y artificiales, que buscan disminuir la concentracion de contaminantes, dicha funcion la cumplen los humedales que tienen importancia a nivel ambiental. Bogota tiene trece humedales, el humedal de Jaboque tiene aproximadamente 148.51 hectareas, y esta ubicado en la localidad de Engativa. Se evaluo la calidad bacteriologica del agua del humedal de Jaboque en epoca seca y epoca de lluvia en el ano 2010 por medio de la determinacion de coliformes totales, Escherichia coli y Enterococcus spp., ademas se caracterizo la presencia de Aeromonas, Pseudomonas y Clostridium. Se utilizo la tecnica de filtracion por membrana y se identificaron los microorganismos con pruebas rapidas Crystal BBL. Se obtuvo como resultado un recuento significativamente alto en UFC/100mL de coliformes totales y Enterococcus spp. con un comportamiento similar en epoca seca y epoca de lluvia, mientras que la cantidad de Escherichia coli aumento en epoca de lluvia. Los generos Pseudomonas y Clostridium mostraron presencia con un recuento significativamente alto en epoca seca y epoca de lluvia y el genero Aeromonas aumento las UFC/100mL en epoca de lluvia. Se compararon los resultados con un estudio previo realizado en 2004-2005 y se determino que la calidad bacteriologica del agua mejoro debido a las intervenciones realizadas en el humedal.