En Colombia las Mipymes representan el 96.4% del total de establecimientos empresariales y generan 80.8% del empleo, tienen presencia en diferentes sectores productivos y contribuyen con un porcentaje considerable al PIB (Plata, 2009). En los planes de desarrollo del departamento de Boyaca para los perio-dos 2008 - 11 y 2012 - 15, el sector agroindustrial es uno de los senalados como promisorios, con poten-cialidades aprovechables. En el presente articulo se analizan y describen caracteristicas de la gerencia en micro, pequenas y medianas empresas (Mipymes) agroindustriales del departamento de Boyaca. Para el desarrollo de la presente investigacion se trabajo sobre 64 empresas agroindustriales procesadoras de alimentos de origen agricola y pecuario ubicadas en las ciudades de Tunja, Duitama y Sogamoso donde se analizaron aspectos referentes a su cultura, estructura organizacional y estrategias empresariales, mane-jadas por gerentes generales. Una vez analizados los resultados obtenidos se evidenciaron algunas fortalezas y debilidades en la gerencia de estas empresas, por lo cual se hace necesario aunar esfuerzos desde diferentes instituciones, para asesorar y capacitar a propietarios, gerentes y personal de las empresas del sector agroindustrial con el fin de definir estrategias basadas en un enfoque de gestion integral.