: En el presente estudio se realizo la caracterizacion de Escherichia coli Enteropatogenica (EPEC) y Escherichia coli Enterohemorragica (EHEC), dos categorias patogenicas de E. coli, causantes de la lesion de adherencia y esfacelacion (EAEE), en muestras de heces diarreicas de ninos menores a 5 anos. Metodo: El perfil patogenico de EAEE se realizo mediante el analisis por PCR, de los genes intimina (eae), bundlina (bfpA) y toxinas siga (stx1 y stx2). Estas pruebas, se complementaron con ensayos fenotipicos de la resistencia a antibioticos, fermentacion de sorbitol y produccion de ?-D-glucoronidasa. Resultados: La prevalencia de EAEE fue del 7% con preponderancia de las cepas EPEC (95%) sobre EHEC. Se encontro una mayor proporcion (83%) de cepas EPEC atipicas que tipicas. Un alto porcentaje de los aislados de EPEC es resistente a mas de 5 antibioticos analizados. La frecuencia de multiresistencia a bloques de 5 y 2 antibioticos sugiere que la resistencia es transmisible por via horizontal. La correlacion entre la pertenencia a un serogrupo particular de EPEC y las caracteristicas genotipicas, mostro heterogeneidad en el perfil de patogenicidad tanto entre un mismo como entre diferentes serogrupos, demostrando que el diagnostico de DEC mediante serotipificacion no es util en nuestro medio. Los aislados de EHEC, se caracterizan por presentar una marcada susceptibilidad a los antibioticos. Se reporta la presencia de los serogrupos O157 y O6. Conclusiones: Este estudio, constituye el primer reporte en nuestro medio sobre la determinacion y caracterizacion geno-fenotipica de EPEC y EHEC por metodos moleculares. En conjunto, los datos obtenidos tienen relevancia para el diagnostico, tratamiento y estudio de la epidemiologia de AEEC en las EDA en Bolivia