En siete sectores del antiguo delta del río Sinú y en diferentes momentos hidrológicos se evaluaron algunas características limnológicas y se identificaron las cianoprocariotas presentes en el sistema, atendiendo a sus caracteres morfológicos y niveles de organización. Los resultados fueron analizados considerando las diferencias ambientales. Se identificaron un total de 49 morfoespecies, distribuidas en 4 órdenes, 8 familias y 14 géneros entre los que se destacan: Microcystis, Merimopedia, Dolichospermum, Aphanocapsa, Anabaenopsis, Lyngbya, Oscillatoria, Pseudanabaena, Stigonema, Gomphosphaeria y Planktolyngbya, y cuya representación varía según el gradiente de salinidad y la concentración de nitratos y amonio en el medio.