Objetivo: identificar el nivel de conocimiento de los empleados acerca de las políticas de investigación en las instituciones de salud de mediana y alta complejidad en el Valle de Aburrá, Colombia. Metodología: investigación de corte transversal, con aplicación de encuestas a 224 empleados en las instituciones prestadoras de servicios salud de alta (52) y mediana complejidad (322), públicas y privadas en el 2011. Resultados: en referencia al conocimiento de la existencia de políticas de investigación, se encontró que este es mayor en los empleados de las instituciones de alta complejidad (p = 0,000). Más del 70 % de los empleados encuestados manifestaron su interés en trabajar en proyectos de investigación. Conclusión: las instituciones de salud de alta complejidad y públicas tuvieron más desarrollos en investigación y se percibió gran interés por la investigación en los empleados del sector salud, con independencia del nivel de complejidad, del tipo de institución y del nivel de formación.