Objetivo. Determinar la presencia de endoparásitos del género Anisakidae en rubio Salminus affinis en el medio natural. Materiales y métodos. Por medio de disección e inspección de las vísceras y la cavidad abdominal fueron analizados 45 ejemplares capturados en los ríos Sinú (n=34) y San Jorge (n=11) (Córdoba, Colombia). Resultados. Larvas terciarias (L3) de nemátodos del género Contracaecum (Nematoda: Anisakidae) fueron halladas en la cavidad visceral de rubio capturados en ambos ríos. La prevalencia de este nemátodo en los dos ríos estudiados fue mayor de 95%. El grado de infestación fue leve en 94.1% de los rubios del río Sinú y el restante 5.9% tuvieron una infestación moderada; mientras que el 100% de los casos del río San Jorge tuvieron un grado de infestación leve. Conclusiones. Los resultados permiten concluir que el rubio de los ríos Sinú y San Jorge se encuentran con un grado de infestación leve del anisákido Contracaecum sp; el cual se encuentra alojado en el tracto digestivo y grasa mesentérica en estado larval terciario (L3).