Los avances de las ciencias basicas y la tecnologia aplicada a los diversos campos de investigacion, facilitan la caracterizacion microbiologica de la mayoria de patologias orales. Es por esto que desde hace un tiempo hasta el presente, metodos que permiten identificar fenotipos tales como cultivos, pruebas bioquimicas y tinciones, se convirtieron en gran ayuda para lograr ese objetivo en la busqueda de respuestas a los interrogantes microbiologicos, lo mismo que sucede en aquellas circunstancias donde los organismos presenten retos para su aislamiento. Es alli donde la identificacion se puede realizar a partir de tecnicas moleculares como la reaccion en cadena de la polimerasa (PCR), hibridacion in situ, secuenciacion, analisis del polimorfismo en los fragmentos de restriccion (RFLP) entre diversos metodos con los que se cuenta en la actualidad. La identificacion adecuada y certera de genotipos en la patologia, permite disenar mejores estrategias de tratamiento que lleven a la curacion de los pacientes y a la implementacion de programas de prevencion optimos, evitando la recidiva de patologias clinicas en la Odontologia moderna. (DUAZARY 2010, 247 - 256)