Las comunidades cientificas se caracterizan por su autonomia y por interactuar en situaciones de incertidumbre, condiciones que las hacen dependientes del grado de confianza que logren construir para el desarrollo de su trabajo. Aunque teoricamente esto es reconocido, pocos estudios empiricos han analizado la relacion de confianza en el trabajo investigativo. Esto motivo la presente investigacion que, desde una perspectiva cualitativa, se llevo a cabo en 16 grupos de investigacion de una universidad publica colombiana. Los resultados muestran que no basta la confianza cognitiva o racional si no se logra tambien una confianza emocional; igualmente, se resalta la importancia de la confianza en el momento de la gestion de los grupos tanto para la consecucion de recursos como para el buen desempeno academico del equipo. Desde los hallazgos se vislumbran nuevos estudios sobre la comunidad cientifica.